Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms