Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms