Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rprd1bQ9CSU0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rprd1bQ9CSU0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms