Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRC3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9CRC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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