Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vta1Q9CR26 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vta1Q9CR26 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms