Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldnd1Q9CQX5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms