Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ykt6Q9CQW1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ykt6Q9CQW1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms