Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PompQ9CQT5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms