Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PsenenQ9CQR7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PsenenQ9CQR7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms