Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl20Q9CQL4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl20Q9CQL4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms