Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Efcab2Q9CQ46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Efcab2Q9CQ46 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcab2Q9CQ46 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efcab2Q9CQ46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efcab2Q9CQ46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms