Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc198Q9CPZ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc198Q9CPZ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc198Q9CPZ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms