Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl17Q9CPR4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl17Q9CPR4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms