Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim26Q99PN3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim26Q99PN3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim26Q99PN3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim26Q99PN3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms