Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2a1Q99PM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2a1Q99PM3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2a1Q99PM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2a1Q99PM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms