Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rad54l2Q99NG0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rad54l2Q99NG0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rad54l2Q99NG0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rad54l2Q99NG0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rad54l2Q99NG0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms