Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cep41Q99NF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cep41Q99NF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms