Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll1Q99NC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms