Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b1Q99NB9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b1Q99NB9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b1Q99NB9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms