Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh8Q99NA2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh8Q99NA2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh8Q99NA2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms