Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac9Q99N13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac9Q99N13 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac9Q99N13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms