Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a6dQ99N07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a6dQ99N07 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a6dQ99N07 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms