Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramel1Q99MW3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel1Q99MW3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel1Q99MW3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms