Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkd1Q99MH6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkd1Q99MH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkd1Q99MH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkd1Q99MH6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkd1Q99MH6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkd1Q99MH6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms