Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp1b1Q99LU0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Chmp1b1Q99LU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms