Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2nlQ99LJ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms