Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cstf3Q99LI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cstf3Q99LI7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms