Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp16Q99LG0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp16Q99LG0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp16Q99LG0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp16Q99LG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms