Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds2Q99L43 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cds2Q99L43 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms