Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1aQ99L02 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pagr1aQ99L02 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms