Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpifQ99KR7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms