Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lactb2Q99KR3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lactb2Q99KR3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lactb2Q99KR3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms