Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp11Q99K46 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp11Q99K46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp11Q99K46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp11Q99K46 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms