Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Higd1bQ99JY6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Higd1bQ99JY6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1bQ99JY6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms