Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GatbQ99JT1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GatbQ99JT1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GatbQ99JT1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GatbQ99JT1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms