Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacsin3Q99JB8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacsin3Q99JB8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms