Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhdcQ99J23 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GhdcQ99J23 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GhdcQ99J23 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GhdcQ99J23 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms