Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcoln1Q99J21 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln1Q99J21 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln1Q99J21 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms