Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim11aQ99J19 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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