Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CsprsQ99388 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsprsQ99388 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsprsQ99388 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms