Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim66Q924W6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim66Q924W6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim66Q924W6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim66Q924W6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim66Q924W6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim66Q924W6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim66Q924W6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim66Q924W6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim66Q924W6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms