Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtpbp3Q923K4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Gtpbp3Q923K4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp3Q923K4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Gtpbp3Q923K4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Gtpbp3Q923K4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Gtpbp3Q923K4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtpbp3Q923K4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtpbp3Q923K4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms