Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Clip1Q922J3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Clip1Q922J3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Clip1Q922J3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Clip1Q922J3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Clip1Q922J3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 443.4 ms