Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp4Q921I6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp4Q921I6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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