Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med28Q920D3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med28Q920D3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms