Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y19

Pcdha11, Protocadherin alpha 11, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha11Q91Y19 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha11Q91Y19 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha11Q91Y19 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha11Q91Y19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms