Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcdhb12Q91Y07 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb12Q91Y07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb12Q91Y07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms