Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx15Q91WE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx15Q91WE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx15Q91WE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms