Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan3Q91VW9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan3Q91VW9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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