Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam3cQ91VU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam3cQ91VU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam3cQ91VU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam3cQ91VU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms